Изначально в комиксах Человек-Паук не умел выпускать паутину из своего тепа, как в трилогии Рейми. Вместо этого он самостоятельно соорудил браслеты, выпускающие быстро затвердевающую жидкость. Это было отражено в новом фильме. Отличие от комиксов лишь в том, что Питеру не приходилось использовать технологию Оскорп.
Одного из своих первых врагов, Песочного Человека, Человек-Паук победил с помощью пылесоса.
Изначально во вселенной Марвел Носорог (Алексей Сицевич получил свои способности от гамма-радиации, и носил он костюм, напоминающий шкуру носорога. Уже во вселенной Ультимат, на которой основывается часть киновсепенной Marvel, его сделали обычным человеком, укравшим экспериментальный механический бронекостюм.
Первым Зелёным Гоблином был Норман Осборн, но потом Гобпинов расплодилось, как тараканов. Был Гобпин-Младший (Гарри Осборн(, а под маской Хобгобпина сменилась целая толпа бандитов. А Норман Осборн успел и погеройствовать в составе собственной команды Тёмных Мстителей. Впрочем, полноценным героем так и не стал.
В самом начале своей карьеры Человек-Паук предпринял попытку присоединиться к Фантастической Четвёрке. Будучи прирождённым дипломатом, он просто явился без приглашения и победил всех четверых, заодно продемонстрировав свою силу (смог поднять и выбросить Нечто, каменного гуманоида(. Питер сам передумал, когда оказалось, что ему за участие не будут ничем выплачивать.
В комиксах чёрный костюм Человека-паука впервые появился в сюжетке, в которой Человек-Паук и другие герои и злодеи Marvel вынуждены были сражаться на далёкой планете под контролем могущественного космического странника. Вернувшись на Землю, Питер обнаружил, что костюм жив и по ночам берёт контроль над его телом. От костюма-симбиота избавились и он попал к Эдди Броку, который стал суперзлодеем по прозвищу Веном. А потом симбиотов стало настолько много, что Веном даже как-то потерялся на их фоне.
После ложного обвинения в убийстве Человеку-Пауку пришлось запечь на дно. Чтобы распугать ситуацию и найти того, кто его подставил, Питер прикинулся сразу четырьмя разными персонажами, притом двое из них были "типа" злодеями. Очистив своё имя, Человек-Паук избавился от своим временных костюмов.
Во вселенной Ultimate после смерти Питера Паркера Человеком-Пауком стал негр Майпс Моралес. Стоит ли ожидать политкорректного Человека-Паука в кино?
Одна из самых запутанных деталей вселенной Человека-Паука - Сага о Кпонах. Сначала выясняется, что Питер Паркер - кпон, а настоящий Человек-Паук -Бен Рейли. Потом оказывается, что Питер - всё-таки настоящий. Ещё и некий Кейн появляется - как выясняется, тоже клон, причём неудачный. Даже некоторые хардкорные фанаты пугаются в клонах.